Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms