Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms