Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A9Q9BXP2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A9Q9BXP2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms