Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NXPE2Q96DL1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NXPE2Q96DL1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NXPE2Q96DL1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NXPE2Q96DL1 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NXPE2Q96DL1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NXPE2Q96DL1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NXPE2Q96DL1 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NXPE2Q96DL1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NXPE2Q96DL1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NXPE2Q96DL1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NXPE2Q96DL1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NXPE2Q96DL1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NXPE2Q96DL1 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NXPE2Q96DL1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms