Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms