Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HIST3H3Q16695 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms