Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
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