Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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