Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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