Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms