Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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MKRN4PQ13434 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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MKRN4PQ13434 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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MKRN4PQ13434 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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MKRN4PQ13434 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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MKRN4PQ13434 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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MKRN4PQ13434 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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