Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms