Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms