Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms