Protein–RNA interactions for Protein: P42568

MLLT3, Protein AF-9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLLT3P42568 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MLLT3P42568 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms