Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7BP35670 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms