Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA3P26006 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms