Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPB42P16452 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPB42P16452 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPB42P16452 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPB42P16452 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPB42P16452 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPB42P16452 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPB42P16452 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPB42P16452 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPB42P16452 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPB42P16452 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPB42P16452 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPB42P16452 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPB42P16452 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPB42P16452 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPB42P16452 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPB42P16452 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPB42P16452 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPB42P16452 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPB42P16452 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPB42P16452 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPB42P16452 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPB42P16452 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPB42P16452 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms