Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GATA1P15976 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GATA1P15976 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GATA1P15976 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GATA1P15976 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GATA1P15976 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GATA1P15976 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GATA1P15976 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GATA1P15976 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GATA1P15976 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GATA1P15976 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GATA1P15976 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GATA1P15976 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
GATA1P15976 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
GATA1P15976 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GATA1P15976 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GATA1P15976 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms