Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1AO15047 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1AO15047 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1AO15047 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1AO15047 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1AO15047 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD1AO15047 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1AO15047 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms