Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F3O00716 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F3O00716 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F3O00716 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F3O00716 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F3O00716 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F3O00716 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F3O00716 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F3O00716 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F3O00716 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F3O00716 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F3O00716 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F3O00716 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F3O00716 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F3O00716 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F3O00716 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F3O00716 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F3O00716 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F3O00716 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms