Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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