Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms