Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms