Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPC1L1Q9UHC9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms