Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT84Q9NSB2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms