Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC17Q9NP64 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms