Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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