Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORT1Q99523 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms