Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms