Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ULK4Q96C45 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms