Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms