Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XIRP1Q702N8 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
XIRP1Q702N8 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XIRP1Q702N8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XIRP1Q702N8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XIRP1Q702N8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
XIRP1Q702N8 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XIRP1Q702N8 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XIRP1Q702N8 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
XIRP1Q702N8 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XIRP1Q702N8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XIRP1Q702N8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XIRP1Q702N8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XIRP1Q702N8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XIRP1Q702N8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XIRP1Q702N8 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XIRP1Q702N8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XIRP1Q702N8 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XIRP1Q702N8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XIRP1Q702N8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XIRP1Q702N8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XIRP1Q702N8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms