Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF7

NXPE4, NXPE family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE4Q6UWF7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NXPE4Q6UWF7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms