Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms