Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 CRYZP1-201ENST00000428923 947 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 AC133965.1-201ENST00000452984 354 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 AC108471.2-205ENST00000529314 628 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 AC007346.1-202ENST00000602826 684 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 LIAS-202ENST00000340169 1485 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 TUBD1-203ENST00000346141 1490 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf48Q5BLP8 LINC02453-201ENST00000501499 1825 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 FAM92A1P2-201ENST00000502308 2455 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 ZNF726-202ENST00000334589 847 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC104455.1-201ENST00000417340 736 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 MYL12A-207ENST00000579226 947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC137735.1-201ENST00000581911 419 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC008993.1-201ENST00000632280 776 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms