Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNAPC1Q16533 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNAPC1Q16533 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms