Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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