Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FOXC1Q12948 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FOXC1Q12948 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FOXC1Q12948 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FOXC1Q12948 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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FOXC1Q12948 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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FOXC1Q12948 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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FOXC1Q12948 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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FOXC1Q12948 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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FOXC1Q12948 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXC1Q12948 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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