Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RAB40BQ12829 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RAB40BQ12829 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RAB40BQ12829 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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RAB40BQ12829 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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RAB40BQ12829 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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