Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms