Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms