Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms