Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN11Q06124 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms