Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms