Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms