Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms