Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms