Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCLMP48507 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms