Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H1P32780 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms